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392189 Algorithms in Comparative Genomics (V) (SoSe 2018)

Einrichtung
Technische Fakultät
Art(en) / SWS
V / 2
Zeitraum
09.04.2018-20.07.2018
Voraussichtl. Wiederholung
Sprache
Diese Veranstaltung wird komplett in englischer Sprache gehalten

Lehrende

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Termine (Kalendersicht )

Rhythmus Tag Uhrzeit Ort Zeitraum  
wöchentlich Fr 10-12 U10-146 09.04.2018-20.07.2018

Klausuren

  • keine gefunden

Fachzuordnungen

Modul (Studienmodell 2011) Veranstaltung Leistungen  
39-Inf-SAB_a Spezielle Algorithmen der Bioinformatik Ausgewählte Vorlesung zu Spezielle Algorithmen der Bioinformatik unbenotete Prüfungsleistung
benotete Prüfungsleistung
Studieninformation

Die Angaben in der Tabelle ergeben sich aus der Zuordnung zu einem Modul und der entsprechenden Modulbeschreibung. Bei den angegebenen "Leistungen" können Wahloptionen der Studierenden bestehen; Auskunft hierüber gibt ebenfalls die Modulbeschreibung.

Allgemeine Anforderungen bei Lehrveranstaltungen:

Die Anforderungen an die aktive Teilnahme (nur gültig für Studienmodell 2002) sind hier erläutert. In den FsB und Modulhandbüchern finden sich Informationen, ob Studienleistungen (nur gültig für Studienmodell 2011)/Einzelleistungen/Modul(teil)prüfungen vorgesehen sind, und welche Anforderungen hierfür bestehen.

Inhalt, Kommentar

Many questions in molecular biology, phylogenetics, and biomedicine can be approached through comparison of two or more genomes. However, a global alignment of multiple large genomes is often infeasible or comes at great expense. It is more efficient to compare genomes on a higher level of abstraction, as given by the succession of single-copy genes or other kinds of unique genomic markers on the chromosomal sequences.

In this course, various models of higher level genome comparison are discussed. We start with the classical reversal distances which are measures to study chromosomal sequences only permuted by inversions. We then continue by discussing distances such as SC/J or DCJ, and a general rearrangement distance. It then follows a discussion of methods that solve the problem of comparing sequences with unequal gene/marker content. We will also study methods for the reconstruction of ancestral genomes.

Algorithms discussed in this course are mostly combinatorial by nature, similar to the sequence analysis course.

This course is taught in German or English if needed.

Teilnahmevoraussetzungen, notwendige Vorkenntnisse

Required: Algorithms and Data Structures (or comparable)
Recommended: Sequence Analysis and Foundations of Genome Research

Externe Kommentarseite

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registrierte Anzahl : 6
Dies ist die Anzahl der Studierenden, die die Veranstaltung im Stundenplan gespeichert haben. In Klammern die Anzahl der über Gastaccounts angemeldeten Benutzer/innen.
Abruf der Liste der Teilnehmer/innen :
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Dort finden Sie auch Informationen dazu, wie Sie aus einer Teilnehmerliste die Ergebnisliste für die Prüfungsdokumentation erstellen und wie Sie diese an die Prüfungsämter übermitteln können.
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Adresse :
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Lehrende, ihre Sekretariate sowie für die Pflege der Veranstaltungsdaten zuständige Personen können über diese Adresse E-Mails an die VeranstaltungsteilnehmerInnen verschicken. WICHTIG: Sie müssen verschickte E-Mails jeweils freischalten. Warten Sie die Freischaltungs-E-Mail ab und folgen Sie den darin enthaltenen Hinweisen.
Falls die Belegnummer mehrfach im Semester verwendet wird können Sie die folgende alternative Verteileradresse nutzen, um die TeilnehmerInnen genau dieser Veranstaltung zu erreichen: VST_118943515@ekvv.uni-bielefeld.de
Reichweite :
6 Studierende direkt per E-Mail erreichbar
Hinweise :
Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
Änderungen/Aktualität der Veranstaltungsdaten
Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende :
Dienstag, 21. November 2017 
Letzte Änderung Zeiten :
Freitag, 2. Februar 2018 
Letzte Änderung Räume :
Freitag, 2. Februar 2018 
Sonstiges
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