Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.
In der Vorlesung werden Algorithmen zum effizienten Vergleich von Sequenzen und zur Suche exakter und approximativer Muster in Sequenzen behandelt. Viele dieser Algorithmen sind durch bioinformatische Fragestellungen motiviert. Sie finden jedoch auch Anwendungen in anderen Bereichen wie z.B. der Textverarbeitung und der Datenkompression.
Algorithmen und Datenstrukturen
siehe externe Kommentarseite
Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum | |
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wöchentlich | Do | 12-14 | M3-115 | 15.10.2007-08.02.2008 | Ü-Termin |
wöchentlich | Do | 14-16 | C01-243 | 15.10.2007-08.02.2008
nicht am: 01.11.07 / 27.12.07 / 03.01.08 |
unverbindlich, Ü-Termin kann kurzfristig geändert werden! |
wöchentlich | Fr | 10-12 | U2-232 | 15.10.2007-08.02.2008
nicht am: 28.12.07 / 04.01.08 |
unverbindlich, Übg.-Termin kann kurzfristig geändert werden! |
einmalig | Di | 14-16 | H16 | 16.10.2007 | Vorlesungstermin nur am 16.10. in H16, sonst H11 |
wöchentlich | Di | 14-16 | H11 | 23.10.2007-08.02.2008
nicht am: 25.12.07 / 01.01.08 |
Vorlesungstermin |
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Datum | Uhrzeit | Format / Raum | Kommentar zum Prüfungstermin |
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Dienstag, 1. April 2008 | 14-16 | H11 |
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Studiengang/-angebot | Gültigkeit | Variante | Untergliederung | Status | Sem. | LP | |
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Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor | (Einschreibung bis SoSe 2011) | Sequenzanalyse | Pflicht | 3. | 5 | benotet | |
Graduate School in Bioinformatics and Genome Research / Promotion | |||||||
Informatik / Bachelor | (Einschreibung bis SoSe 2011) | Nebenfach | Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 5. | 5 | benotet |
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor | (Einschreibung bis SoSe 2011) | Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 5. | 5 | benotet | |
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Einschreibung bis SoSe 2004) | BioI; allgem.HS | HS |