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392012 Sequenzanalyse II (V) (SoSe 2012)

Inhalt, Kommentar

Algorithmische Fragestellungen bei der Analyse endlicher Zeichenketten werden in der mathematischen und informatischen Literatur schon seit langer Zeit untersucht. Einen deutlichen Schub hat diese Forschung in den 1980er und 1990er Jahren durch das Aufkommen der Bioinformatik erhalten. Dieser Schub begründet sich einerseits qualitativ durch neue Fragestellungen aus der bioinformatischen Anwendung, andererseits quantitativ durch die enorme Größe der Datenmengen, mit denen man es im bioinformatischen Kontext zu tun hat.

Diese Vorlesung setzt die Veranstaltung " Sequenzanalyse I" aus dem WS 2011/12 fort, in der algorithmische Fragestellungen in der Sequenzanalyse behandelt werden, die durch die Bioinformatik aufgeworfen werden. Behandelte Themengebiete sind das paarweise und multiple Sequenzalignment in verschiedenen Varianten: linearer Platzbedarf, längennormalisierte Scores, parametrisches Alignment, exakte und heuristische Verfahren.

Zu dieser Veranstaltungen wird eine freiwillige Übung im Individuellen Ergänzungsbereich angeboten, ähnlich der Tutorien zu Sequenzanalyse I im Wintersemester.

Lehrende

Termine (Kalendersicht )

Rhythmus Tag Uhrzeit Format / Ort Zeitraum  
wöchentlich Fr 8-10 V2-205 02.04.2012-13.07.2012
nicht am: 06.04.12

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Klausuren

Datum Uhrzeit Format / Raum Kommentar
Montag, 23. Juli 2012 10-12 H7

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Sequenzanalyse Pflicht 4. 3 benotet  
Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Nebenfach Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Molekulare Biotechnologie / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Spezialisierung Biotech Wahlpflicht 2. 4. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004) allgem.HS Wahlpflicht HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Sequenzanalyse Wahlpflicht 2. 3 benotet  
Konkretisierung der Anforderungen
Keine Konkretisierungen vorhanden
Lernraum
Teilnehmer*innen
Automatischer E-Mailverteiler der Veranstaltung
Änderungen/Aktualität der Veranstaltungsdaten
Sonstiges