392224 Detection of Genomic Structural Variations (S) (WiSe 2018/2019)
Contents, comment
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Neben kleinen Veränderungen im Genom, wie der Mutation, der Löschung oder dem Hinzufügen einzelner Basen, spielen vor allem größere, sogenannte "strukturelle Variationen", wie das Löschen, Verschieben, Verdoppeln, Invertieren von längeren Sequenzabschnitten eine große Rolle, zum Beispiel bei der Entwicklung von Krebs. Die Hochdurchsatz-Sequenzierung von kompletten Genomen bietet verschiedene Möglichkeiten, strukturelle Variationen zu detektieren.
In diesem Seminar wollen wir Techniken zur Detektion von strukturellen Variationen betrachten -- aber auch einige Grundlagen, Analysetechniken, etc.
Es handelt sich um ein klassisches Literaturseminar. Am ersten Veranstaltungstag werden verschiedene Themen vorgestellt und an die Teilnehmenden verteilt. In anschließenden Sitzungen tragen Teilnehmende über das gewählte Thema vor und fertigen im Nachklang eine Hausarbeit an. Nach Bedarf wird auch die Thematik des wissenschaftlichen Vortragens und Schreibens besprochen.
Requirements for participation, required level
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Sequenzanalyse
Bibliography
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Alle weitere Informationen finden sich auf der externen Kommentarseite.
External comments page
Teaching staff
Dates ( Calendar view )
| Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period | |
|---|---|---|---|---|---|
| weekly | Mo | 10-12 | U10-146 | 08.10.2018-01.02.2019
not on: 11/5/18 / 12/17/18 / 12/24/18 / 12/31/18 / 1/14/19 / 1/21/19 / 1/28/19 |
Subject assignments
| Module | Course | Requirements | |
|---|---|---|---|
| 39-Inf-AB Algorithmen der Bioinformatik | Ausgewähltes Seminar zu Algorithmen der Bioinformatik | Study requirement
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Student information |
| 39-Inf-SAB_a Spezielle Algorithmen der Bioinformatik | Ausgewähltes Seminar zu Spezielle Algorithmen der Bioinformatik | Study requirement
|
Student information |
The binding module descriptions contain further information, including specifications on the "types of assignments" students need to complete. In cases where a module description mentions more than one kind of assignment, the respective member of the teaching staff will decide which task(s) they assign the students.
| Degree programme/academic programme | Validity | Variant | Subdivision | Status | Semester | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Studieren ab 50 |
- Vortrag (ca. 30-45 Minuten)
- Hausarbeit (ca. 8-15 Seiten)
- Address:
- WS2018_392224@ekvv.uni-bielefeld.de
- This address can be used by teaching staff, their secretary's offices as well as the individuals in charge of course data maintenance to send emails to the course participants. IMPORTANT: All sent emails must be activated. Wait for the activation email and follow the instructions given there.
- If the reference number is used for several courses in the course of the semester, use the following alternative address to reach the participants of exactly this: VST_133283275@ekvv.uni-bielefeld.de
- Notes:
- Additional notes on the electronic mailing lists
- Last update basic details/teaching staff:
- Friday, August 24, 2018
- Last update times:
- Thursday, August 23, 2018
- Last update rooms:
- Thursday, August 23, 2018
- Type(s) / SWS (hours per week per semester)
- seminar (S) / 2
- Department
- Faculty of Technology
- Questions or corrections?
- Questions or correction requests for this course?
- Planning support
- Clashing dates for this course
- Links to this course
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