392114 Algorithmische Stochastik in der Bioinformatik (V) (WiSe 2009/2010)
Contents, comment
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Viele komplexe Probleme der Bio- und allgemeiner der naturwissenschaftlichen Informatik (z.B. Alignment, Gene finding, Inferenz für Populationssequenzdaten) lassen sich nicht gleichzeitig effizient und optimal mit deterministischen Verfahren lösen; in diesem Fall nimmt man oft stochastische Methoden zur Hilfe. Aufbauend auf stochastischen Grundlagen aus der Wahrscheinlichkeitstheorie und Statistik legt dieses Modul die nötigen Grundlagen (Darstellung von Verteilungen im Computer; Rechnen mit sehr kleinen Wahrscheinlichkeiten; Effiziente Generierung von Zufallszahlen aus vorgegebenen Verteilungen; Testen der Qualität von Zufallszahlengeneratoren). Als ein wichtiges Hilfsmittel werden Markov Chain Monte Carlo Methoden (Metropolis-Hastings; Gibbs sampler) anhand von Anwendungsbeispielen vorgestellt, sowie Methoden des
importance sampling und der Simulation seltener Ereignisse.
Requirements for participation, required level
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Mathematik fuer Informatiker I und II,
Mathematische Methoden der Biowissenschaften I und II, Sequenzanalyse
Nützlich: Grundkenntnisse in numerischer Mathematik
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Teaching staff
Dates ( Calendar view )
| Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period | |
|---|---|---|---|---|---|
| weekly | Do | 16-18 | 12.10.2009-05.02.2010 |
Subject assignments
| Degree programme/academic programme | Validity | Variant | Subdivision | Status | Semester | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor | (Enrollment until SoSe 2011) | Algorithmische Stochastik | Wahlpflicht | 5. | 7 | unbenotet 7 LP V+Ü | |
| Bioinformatik und Genomforschung / Master | (Enrollment until SoSe 2012) | Algorithmische Stochastik | Wahlpflicht | 1. | 7 | unbenotet / benotet (7LP für V+Ü) | |
| Bioinformatik und Genomforschung / Promotion | Indiv. Erg. | Wahl | 7 | 7 LP V+Ü | |||
| Mathematik / Diplom | (Enrollment until SoSe 2008) | Wahl | HS | ||||
| Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Enrollment until SoSe 2004) | allgem.HS | HS | ||||
| Naturwissenschaftliche Informatik / Master | (Enrollment until SoSe 2012) | Algorithmische Stochastik | Wahlpflicht | 1. | 7 | unbenotet / benotet (7LP für V+Ü) |
regelmäßige und aktive Teilnahme an den Übungen;
Erbringen des Portfolios aus Übungsaufgaben und Abschlussklausur
oder mündlicher Abschlussprüfung (Näheres siehe Modulhandbuch,
und erste Vorlesungsstunde)
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- WS2009_392114@ekvv.uni-bielefeld.de
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- Notes:
- Additional notes on the electronic mailing lists
- Last update basic details/teaching staff:
- Friday, December 11, 2015
- Last update times:
- Thursday, September 26, 2013
- Last update rooms:
- Thursday, November 12, 2009
- Type(s) / SWS (hours per week per semester)
- lecture (V) / 2
- Department
- Faculty of Technology
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- Questions or correction requests for this course?
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