201080 Block: Anwendungen in der Genomforschung (Pr+Ü) (WiSe 2004/2005)

Kurzkommentar

Vorbespr.: 09.03., 14 c.t., V6-138 Anmeldungen per email an fm@cebitec.uni-bielefeld.de

Inhalt, Kommentar

Typische Genome enthalten Tausende von Genen. Die Auswertung dieser Datenflut ist nur mit bioinformatischen Methoden möglich. Im Rahmen dieses Blocks sollen von den Rohdaten vom Sequenzierautomaten bis zum fertig annotierten Genom alle Arbeitsschritte (zumindest exemplarisch) an einem Beispieldatensatz geübt werden. Dies beinhaltet die folgenden Teilschritte:

  • UNIX Grundkenntnisse
  • Datenmanagement (mit UNIX-Kommandozeile, das Werkzeug "make")
  • Zusammenbau der Einzelsequenzen ("Assembly")
  • Bestimmung von potentiellen Genen ("gene prediction")
  • Vergleich mit Sequenzdatenbanken ("blast", "pfam")
  • Erstellung einer Web-Oberfläche für die gesamten Daten

Die Teilnehmer erhalten die Möglichkeit, alle Arbeitsschritte selbest am Rechner durchzuführen und werden dabei unterstützt. (Rechner = UNIX) Teilnehmerkreis: Hauptstudium, Vorbereitung auf die Diplomarbeit. Scheinkriterien: regelmäßige Teilnahme, Vortrag, Protokoll oder Präsentation der eigenen im Rahmen des Blocks entwickelten Lösung.

Lehrende

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Algorithmen in der Genom Wahlpflicht 2. 4 unbenotet Beginn: 21.3.05  
Biologie / Diplom (Einschreibung bis WiSe 02/03) f+g Wahlpflicht HS
Biologie / Lehramt Sekundarstufe II A2+D3 Wahlpflicht HS
Molekulare Biotechnologie / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004)   HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004) BioI   Beginn: 21.3.05 HS

Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein E-Learningangebot vorhanden
registrierte Anzahl: 0
Dies ist die Anzahl der Studierenden, die die Veranstaltung im Stundenplan gespeichert haben. In Klammern die Anzahl der über Gastaccounts angemeldeten Benutzer*innen.
Teilnahmebegrenzung:
Begrenzte Anzahl Teilnehmer*innen: 8
Adresse:
WS2004_201080@ekvv.uni-bielefeld.de
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Falls die Belegnummer mehrfach im Semester verwendet wird können Sie die folgende alternative Verteileradresse nutzen, um die Teilnehmer*innen genau dieser Veranstaltung zu erreichen: VST_1119427@ekvv.uni-bielefeld.de
Reichweite:
Keine Studierenden per E-Mail erreichbar
Hinweise:
Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Freitag, 11. Dezember 2015 
Letzte Änderung Zeiten:
Freitag, 10. Dezember 2004 
Letzte Änderung Räume:
Freitag, 10. Dezember 2004 
Art(en) / SWS
Praktikum (Pr) + Übung (Ü) / 8+2
Einrichtung
Fakultät für Biologie
Fragen oder Korrekturen?
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Planungshilfen
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1119427