In diesem Praktikum werden Proteom-Untersuchung am Beispiel von CHO-Zellen im differentiellen Ansatz durchgeführt.
Haupt-Ziel des Praktikums ist es, Methoden der Proben-Vorbereitung (Fraktionierung, Extraktion, Reinigung, Quantifizierung, Digest ...) kennen zu lernen, und mit diesen Proben selbständig MS-Analysen durchzuführen - also u.a. nanoLC-MS-Messungen zu starten, und anschließend Software-Auswertungen (Protein-Identifizierungen und -Quantifizierungen, PTM-Auswertungen) durchzuführen.
Weiterhin werden die Proben für Gel-basierte Methoden verwendet (2DE, PAGE, Westernblot), mit dem Ziel das extrahierte Proteom darzustellen, oder aber (im Westernblot) Histon-Modifikationen nachzuweisen.
Techniken im Einzelnen:
- Organell-Fraktionierung
- 2DE-Gele + Software-Auswertung (Delta2D), Spot-Picking
- SDS-PAGE, Banden-Präparation, u.a. Histon-Banden
- Tryptische Verdaus
- LC-MALDI-MS + NanoLC-ESI-MS/MS, Auswerte-Software zur Protein-Identifizierung und -Quantifizierung
- manuelle ESI-MS-Messungen
- PTM-Analyse von Histonen
Die wichtigsten Ergebnisse sollen in einem Protokoll in Tabellen und Abbildungen dargestellt und beschrieben, sowie kurz diskutiert werden.
Wichtige Information für Studentinnen:
Sofern eine Schwangerschaft bekannt wird, ist eine Arbeit in den Laboren nicht ohne Weiteres möglich. Hier steht moralisch und gesetzlich der Schutz des Ungeborenen im Vordergrund. Für das weitere Vorgehen bitte unverzüglich Kontakt aufnehmen mit dem Studiengangkoordinator Dominik Cholewa: mbt.techfak@uni-bielefeld.de. Zusammen mit dem Studiengangskoordinator werden dann diskret alle nötigen Vorkehrungen getroffen und alle Möglichkeiten für das Studium mit Kind belichtet.
Diese Information erfolgt auch jährlich bei den Sicherheitsunterweisungen der Labore im Fachbereich.
Teilnehmende sollten an der Veranstaltung "391008: Prozessmesstechnik und Analytik/Proteomics" oder "391009: MS-Analytik, Proteomik und zelluläre Signalverschaltung" teilgenommen haben.
Im Einzelfall kann, bei Erfüllung ähnlicher Voraussetzungen, auch davon unabhängig eine Teilnahme, nach Rücksprache, ermöglicht werden.
Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period | |
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block | Block | 07.04.-18.07.2025 | |||
block | Block | 07.04.-18.07.2025 |
Module | Course | Requirements | |
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39-M-MBT9P_b Spezialisierung Proteomanalyse tierischer Zelllinien | Praktikum Proteomanalyse tierischer Zelllinien | Ungraded examination
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Student information |
The binding module descriptions contain further information, including specifications on the "types of assignments" students need to complete. In cases where a module description mentions more than one kind of assignment, the respective member of the teaching staff will decide which task(s) they assign the students.