392181 Ancestral reconstruction of MtDNA genomes (Pj) (WiSe 2016/2017)

Inhalt, Kommentar

RINGO is a software that is used for ancestral reconstruction of gene orders. Here, we will use the snakemake workflow management system to develop scripts that will help users to quickly use genome data from NCBI, in the form of genbank flatfiles, to generate all the files needed for RINGO to perform the ancestral reconstruction for the input genomes, with varying parameters and input types. The focus is to use MtDNA genomes, that have a very conserved set of genes, but this approach could be easily extended to any type of genomes.

Lehrende

Fachzuordnungen

Modul Veranstaltung Leistungen  
39-M-Inf-P_BI Projekt Bioinformatik Projekt unbenotete Prüfungsleistung
Studieninformation

Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.

Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein E-Learningangebot vorhanden
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WS2016_392181@ekvv.uni-bielefeld.de
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Hinweise:
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Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Dienstag, 13. Dezember 2016 
Letzte Änderung Zeiten:
?
Letzte Änderung Räume:
?
Art(en) / SWS
project (Pj) / 4
Einrichtung
Faculty of Technology
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90269971