202112 Spezialmodul "Plasmide und konjugativer Gentransfer" (Pr+Ü) (SoSe 2016)

Ziel des Praktikums ist es, eine experimentelle Strategie zur Charakterisierung von Plasmiden zu erarbeiten. In einer Gruppe von Xanthomonas-Stämmen sollen Plasmide identifiziert werden. Die Plasmide werden gereinigt und anschließend charakterisiert. Ein Schwerpunkt bilden Experimentezur Beantwortung der Frage, ob die Plasmide konjugativ sind. Zur Charakterisierung der Plasmide können eine Reihe von Parametern herangezogen werden, z.B. Größe, Restriktionskarten, Inkompatibilitätsgruppen, Wirtsbereich, Genfracht wie z.B. Antibiotikaresistenzen, Fähigkeit zur Konjugation oder Mobilisierung.
Der Praktikumsablauf ist nicht strikt vorgegeben, sondern richtet sich nach den jeweiligen Ergebnissen. So können z.B. die Experimente auf eine ausführliche Charakterisierung eines Plasmides fokussiert werden und möglicherweise in Richtung der Entwicklung von Vektoren führen, alternativ könnten auch mehrere Plasmide unter bestimmten Aspekten verglichen werden.
Als Methoden werden vermittelt: verschiedene Plasmidisolierungsmethoden; Restriktionsanalyse; Konjugation und Mobilisierung; PCR; Transposonmutagenese (in vivo, in vitro); Southernhybridisierung; SDS PAGE;

Bibliography

Knippers: Molekulare Genetik.