392017 Phylogenetics (V) (WiSe 2024/2025)
Inhalt, Kommentar
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Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik und umfasst ein großes Repertoire an algorithmischen Problemstellungen und Lösungstechniken. In dieser Vorlesung werden traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Dabei liegt ein klarer Schwerpunkt auf der algorithmischen Problembehandlung, welche über die Phylogenetik hinaus Anwendung finden:
- Graphentheorie
- Dynamische Programmierung
- Komplexitätsanaylse
- Clusteringverfahren
- Maximum Likelihood
Themen werden u.a. sein:
- Diskussion der mathematischen und biologischen Grundbegriffe
- Formalisierungen des Baumrekonstruktionsproblems
- Merkmals- und distanzbasierte Rekonstruktionsalgorithmen
- Statistische Modellierung von Evolution und Maximum-Likelihood-Baumrekonstruktion
- Bewertung der Qualität von rekonstruierten Bäumen
Die Vorlesung wird je nach pandemischer Lage in Präsenz oder online abgehalten werden. Inhalte sind in einem ausführlichen Vorlesungsskript erläutert und werden per (Online-)Vorlesung und -Tutorium (live) mithilfe von weiteren Abbildungen und des Einsatzes viel farbiger Kreide bzw. eines digitalen Whiteboards erarbeitet. Weitere Details hierzu werden im Lernraum bekanntgegeben.
Literaturangaben
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- J. Felsenstein. Inferring Phylogenies. Sinauer, 2004.
- R. D. M. Page, E. C. Holmes. Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell, 1998.
- D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution. Sinauer, 2000.
- D. M. Hillis, C. Moritz, B. K. Mable. Molecular Systematics. Sinauer, 1996.
- M.A. Steel and C. Semple. Phylogenetics. Oxford University Press, 2003.
Externe Kommentarseite
Lehrende
Termine ( Kalendersicht )
| Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum | |
|---|---|---|---|---|---|
| wöchentlich | Do | 10-12 | U10-146 | 07.10.2024-31.01.2025 |
Fachzuordnungen
| Modul | Veranstaltung | Leistungen | |
|---|---|---|---|
| 39-Inf-AB Algorithmen der Bioinformatik | Ausgewählte Vorlesung zu Algorithmen der Bioinformatik | unbenotete Prüfungsleistung
benotete Prüfungsleistung |
Studieninformation |
| 39-Inf-WP-AP Algorithmen & Programmierung (Basis) | Einführende Vorlesung | Studieninformation | |
| - | benotete Prüfungsleistung | Studieninformation | |
| 39-Inf-WP-AP-x Algorithmen & Programmierung (Schwerpunkt) | Einführende Veranstaltung Seminar o. Vorlesung | Studieninformation | |
| - | benotete Prüfungsleistung | Studieninformation | |
| 39-Inf-WP-CLS Computational Life Sciences (Basis) | Einführende Vorlesung | Studieninformation | |
| - | benotete Prüfungsleistung | Studieninformation | |
| 39-Inf-WP-CLS-x Computational Life Sciences (Schwerpunkt) | Einführende Veranstaltung Seminar o. Vorlesung | Studieninformation | |
| - | benotete Prüfungsleistung | Studieninformation |
Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.
Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein Lernraum vorhanden
- registrierte Anzahl: 2
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- Reichweite:
- 2 Studierende direkt per E-Mail erreichbar
- Hinweise:
- Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
- Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
- Montag, 27. Mai 2024
- Letzte Änderung Zeiten:
- Montag, 27. Mai 2024
- Letzte Änderung Räume:
- Montag, 27. Mai 2024
- Art(en) / SWS
- V / 2
- Einrichtung
- Technische Fakultät
- Fragen oder Korrekturen?
- Fragen oder Korrekturwünsche zu dieser Veranstaltung?
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- Terminüberschneidungen für diese Veranstaltung
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