Dieses Projekt wird sich mit der Realisation eines Zelleditors befassen. Dieser soll in der Lage sein, verschiedene Zelltypen (z.B. Hapatozyten, Pflanzenzellen) mit ihren unterschiedlichen Zellkomponenten (z.B. Nuclei, Mitochondrien, Golgi-Apparat) drei-dimensional modellieren zu können. Für die wichtigsten Komponenten stehen bereits 3D-Modelle zur Verfügung, weitere werden folgen. Ein modularer, erweiterungsfähiger Aufbau wird somit unabdingbar sein. Desweiteren sollen die Ergebnisse aus den CELLmicrocosmos 2.0/2.1 Projekt integriert werden, wobei es sich um Membran-Modelle handelt.
Ziel:
Das Resultat wird nicht eine 100% realistische Zelle sein (können), aber ein optisch und schematisch auch für biologische Zwecke sinnvoll einsetzbares Zellmodell. Die Visualisierung und Navigation durch dieses 3D-Modell soll anschließend mit Hilfe unseres Labor-Equipments erfolgen.
Programmiersprache:
Als Programmiersprache wird JAVA vorgeschlagen. Andere Möglichkeiten können aber diskutiert werden.
Ablauf:
Zunächst werden themen-einführende kurze(!) Referate verteilt werden, die einzeln zu bearbeiten sind. Die programmierpraktische Arbeit sollte anschließend in Gruppen erfolgen. Der zeitliche Ablauf des Seminars wird in den ersten Sitzungen festgelegt werden.
Vorbesprechung:
Mittwoch, 11.04.2007, 14:00 Uhr c.t., Raum C5-151
Die Teilnehmer werden in alle Arbeitsprozesse wie Entwurf, Konzeption, Realisierung, Kommentierung etc. involviert sein. Eigeninitiative und -organisation sind wichtige Eigenschaften, die jeder Teilnehmer mit- und einbringen sollte. Zellbiologische Vorkenntnisse sind sehr hilfreich, aber nicht obligatorisch für die Teilnahme. Erste programmierpraktische Erfahrungen sind unabdingbar sowie natürlich die Bereitschaft, sich in die zellbiologische Thematik einzuarbeiten.
Weitere Infos:
www.CELLmicrocosmos.org
Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum | |
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block | Block | 02.04.-13.07.2007 | Vorbesprechung Mo 16.4.07, 14h c.t. in C5-151 |
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Studiengang/-angebot | Gültigkeit | Variante | Untergliederung | Status | Sem. | LP | |
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Bioinformatik und Genomforschung / Master | (Enrollment until SoSe 2012) | Informationssysteme | Wahlpflicht | 6 | |||
Medieninformatik und Gestaltung / Bachelor | (Enrollment until SoSe 2011) | Wahlpflicht Medieninformatik | Wahlpflicht | 6 | |||
Medienwissenschaft, interdisziplinäre / Master | (Enrollment until SoSe 2014) | Modul 4 | 6 | ||||
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Enrollment until SoSe 2004) | allgem.HS; BioI | HS |