392105 Sequenzanalyse (V) (SoSe 2021)
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- Die Veranstaltung findet live per Videokonferenz statt.
Contents, comment
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Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.
In der Vorlesung werden Algorithmen zum effizienten Vergleich von Sequenzen und zur Suche exakter und approximativer Muster in Sequenzen behandelt. Viele dieser Algorithmen sind durch bioinformatische Fragestellungen motiviert. Sie finden jedoch auch Anwendungen in anderen Bereichen wie z.B. der Textverarbeitung und der Datenkompression.Die Veranstaltung findet live per Videokonferenz statt.
Requirements for participation, required level
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Algorithmen und Datenstrukturen (A&D)
Bibliography
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- Das Skript zur Vorlesung (siehe https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2020summer/sa)
- Prof. Volker Heun an der TU München hat auch eine gute Skriptsammlung (https://www.bio.ifi.lmu.de/mitarbeiter/volker-heun/notes/index.html).
- Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press, New York, 1997.
- Setubal, J. and Meidanis, J.: Introduction to Computational Biology. PWS Publishing, Boston, M.A., 1997.
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Teaching staff
Dates ( Calendar view )
| Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period |
|---|
Subject assignments
| Module | Course | Requirements | |
|---|---|---|---|
| 39-Inf-12_ver1 Sequenzanalyse | Sequenzanalyse | Ungraded examination
Graded examination |
Student information |
| 39-M-MBT12 Spezialisierung Biologie/Chemie/Informatik/Physik/Gesundheitswissenschaften 1 | Spezialisierungsmodule Biologie, Biochemie, Bioinformatik, Chemie und Genomforschung | Student information |
The binding module descriptions contain further information, including specifications on the "types of assignments" students need to complete. In cases where a module description mentions more than one kind of assignment, the respective member of the teaching staff will decide which task(s) they assign the students.
| Degree programme/academic programme | Validity | Variant | Subdivision | Status | Semester | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Studieren ab 50 |
Zur Teilnahme an der Vorlesung und Klausur sind diejenigen berechtigt, welche die A&D-Klausur bestanden haben oder im WS2018/19 zur A&D-Klausur zugelassen waren.
- Address:
- SS2021_392105@ekvv.uni-bielefeld.de
- This address can be used by teaching staff, their secretary's offices as well as the individuals in charge of course data maintenance to send emails to the course participants. IMPORTANT: All sent emails must be activated. Wait for the activation email and follow the instructions given there.
- If the reference number is used for several courses in the course of the semester, use the following alternative address to reach the participants of exactly this: VST_256438219@ekvv.uni-bielefeld.de
- Notes:
- Additional notes on the electronic mailing lists
- Email archive
- Number of entries 0
- Open email archive
- Last update basic details/teaching staff:
- Tuesday, December 22, 2020
- Last update times:
- Monday, June 7, 2021
- Last update rooms:
- Monday, June 7, 2021
- Type(s) / SWS (hours per week per semester)
- lecture (V) / 3
- Department
- Faculty of Technology
- Questions or corrections?
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