392012 Sequenzanalyse II (V) (SoSe 2011)

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Algorithmische Fragestellungen bei der Analyse endlicher Zeichenketten werden in der mathematischen und informatischen Literatur schon seit langer Zeit untersucht. Einen deutlichen Schub hat diese Forschung in den 1980er und 1990er Jahren durch das Aufkommen der Bioinformatik erhalten. Dieser Schub begründet sich einerseits qualitativ durch neue Fragestellungen aus der bioinformatischen Anwendung, andererseits quantitativ durch die enorme Größe der Datenmengen, mit denen man es im bioinformatischen Kontext zu tun hat.

Diese Vorlesung setzt die Veranstaltung "Grundlagen der Sequenzanalyse" aus dem WS 2010/11 fort, in der algorithmische Fragestellungen in der Sequenzanalyse behandelt werden, die durch die Bioinformatik aufgeworfen werden. Behandelte Themengebiete sind das paarweise und multiple Sequenzalignment in verschiedenen Varianten: linearer Platzbedarf, längennormalisierte Scores, parametrisches Alignment, exakte und heuristische Verfahren.

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Frequency Weekday Time Format / Place Period  
weekly Mo   04.04.-15.07.2011
weekly Fr 8-10 H11 29.04.-15.07.2011
not on: 5/20/11 / 6/24/11 / 7/15/11
one-time Di 8-10 H15 10.05.2011
one-time Di 8-10 H15 17.05.2011
one-time Di 8-10 H15 24.05.2011
one-time Di 8-10 H15 07.06.2011
one-time Fr 8-10 H11 15.07.2011
one-time Mo 10-12 H11 18.07.2011 Klausurtermin

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Examinations

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Friday, September 16, 2011 10-12 H11 Nachklausur

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Subject assignments

Degree programme/academic programme Validity Variant Subdivision Status Semester LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Sequenzanalyse Pflicht 4. 3 benotet  
Informatik / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Nebenfach Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Molekulare Biotechnologie / Master (Enrollment until SoSe 2012) Spezialisierung Biotech Wahlpflicht 2. 4. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Enrollment until SoSe 2004) allgem.HS Wahlpflicht HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Enrollment until SoSe 2012) Sequenzanalyse Wahlpflicht 2. 3 benotet  

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Friday, December 11, 2015 
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Friday, July 22, 2011 
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Thursday, July 21, 2011 
Type(s) / SWS (hours per week per semester)
lecture (V) / 2
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Faculty of Technology
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