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392018 Phylogenetik (V) (WiSe 2010/2011)

Inhalt, Kommentar

Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten
Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar
algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur
Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden
u.a. sein:

  • Diskussion der mathematischen und biologischen Grundbegriffe
  • Formalisierungen des Baumrekonstruktionsproblems
  • Merkmals- und distanzbasierte Rekonstruktionsalgorithmen
  • Statistische Modellierung von Evolution und Maximum-Likelihood-

Baumrekonstruktion

  • Bewertung der Qualität von rekonstruierten Bäumen

Literaturangaben

J. Felsenstein. Inferring Phylogenies. Sinauer, 2004.
R. D. M. Page, E. C. Holmes. Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell, 1998.
D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution. Sinauer, 2000.
D. M. Hillis, C. Moritz, B. K. Mable. Molecular Systematics. Sinauer, 1996.
M.A. Steel and C. Semple. Phylogenetics. Oxford University Press, 2003.

Externe Kommentarseite

http://wiki.techfak.uni-bielefeld.de/gi/Teaching/2010winter/Phylogenetik

Lehrende

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Klausuren

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Spezielle Algorithmen Pflicht 5. 4 benotet  
Bioinformatik und Genomforschung / Promotion Indiv. Erg.   4  
Graduate School in Bioinformatics and Genome Research / Promotion   4  
Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Nebenfach Spezielle Algorithmen der Bio Wahlpflicht 5. 4 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Spezielle Algorithmen Wahlpflicht 5. 4 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004) BioI   Teilleistung mündliche Prüfung möglich HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Spezielle Algorithmen Wahlpflicht 1. 4 benotet  
Konkretisierung der Anforderungen
Keine Konkretisierungen vorhanden
Lernraum
TeilnehmerInnen
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Änderungen/Aktualität der Veranstaltungsdaten
Sonstiges