392012 Sequenzanalyse II (V) (SoSe 2010)

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Algorithmische Fragestellungen bei der Analyse endlicher Zeichenketten werden in der mathematischen und informatischen Literatur schon seit langer Zeit untersucht. Einen deutlichen Schub hat diese Forschung in den 1980er und 1990er Jahren durch das Aufkommen der Bioinformatik erhalten. Dieser Schub begründet sich einerseits qualitativ durch neue Fragestellungen aus der bioinformatischen Anwendung, andererseits quantitativ durch die enorme Größe der Datenmengen, mit denen man es im bioinformatischen Kontext zu tun hat.

Diese Vorlesung setzt die Veranstaltung "Grundlagen der Sequenzanalyse" aus dem WS 2009/10 fort, in der algorithmische Fragestellungen in der Sequenzanalyse behandelt werden, die durch die Bioinformatik aufgeworfen werden. Behandelte Themengebiete sind das paarweise und multiple Sequenzalignment in verschiedenen Varianten: linearer Platzbedarf, längennormalisierte Scores, parametrisches Alignment, exakte und heuristische Verfahren.

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Degree programme/academic programme Validity Variant Subdivision Status Semester LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Sequenzanalyse Pflicht 4. 3 benotet  
Informatik / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Nebenfach Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Enrollment until SoSe 2011) Sequenzanalyse Wahlpflicht 6. 3 benotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Enrollment until SoSe 2004) allgem.HS Wahlpflicht HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Enrollment until SoSe 2012) Sequenzanalyse Wahlpflicht 2. 3 benotet  

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Friday, December 11, 2015 
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Thursday, September 26, 2013 
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Friday, September 3, 2010 
Type(s) / SWS (hours per week per semester)
lecture (V) / 2
Department
Faculty of Technology
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