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392105 Grundlagen der Sequenzanalyse (V) (WiSe 2009/2010)

Inhalt, Kommentar

Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.
In der Vorlesung werden Algorithmen zum effizienten Vergleich von Sequenzen und zur Suche exakter und approximativer Muster in Sequenzen behandelt. Viele dieser Algorithmen sind durch bioinformatische Fragestellungen motiviert. Sie finden jedoch auch Anwendungen in anderen Bereichen wie z.B. der Textverarbeitung und der Datenkompression.

Teilnahmevoraussetzungen, notwendige Vorkenntnisse

Algorithmen und Datenstrukturen oder Grundlagen der Programmierung

Externe Kommentarseite

http://wiki.techfak.uni-bielefeld.de/gi/Teaching/2009winter/SequenzAnalyse

Lehrende

Termine (Kalendersicht )

Rhythmus Tag Uhrzeit Ort Zeitraum  
wöchentlich Do 8-10:00 H5 12.10.2009-05.02.2010
nicht am: 24.12.09 / 31.12.09 / 28.01.10

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Klausuren

Datum Uhrzeit Raum Kommentar
Donnerstag, 11. Februar 2010 8:30-10:00 H5
Freitag, 5. März 2010 8-10 H5 Nachklausur

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Sequenzanalyse Pflicht 3. 5 benotet LP für V+Ü  
Bioinformatik und Genomforschung / Promotion Indiv. Erg. Wahl  
Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Nebenfach Sequenzanalyse Wahlpflicht 5. 5 benotet LP für V+Ü  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Sequenzanalyse Wahlpflicht 5. 5 benotet LP für V+Ü  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004) BioI; allgem.HS   HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Sequenzanalyse Wahlpflicht 1. 5 benotet LP für V+Ü  
Konkretisierung der Anforderungen
Keine Konkretisierungen vorhanden
Lernraum
Teilnehmer*innen
Automatischer E-Mailverteiler der Veranstaltung
Änderungen/Aktualität der Veranstaltungsdaten
Sonstiges