392177 Bioinformatische Anwendungen in der Genomforschung (Pr) (SoSe 2009)

In diesem Modul werden praktische Anwendungen und Problemstellungen beim
Einsatz bioinformatischer Techniken in der Genomforschung behandelt. Das
Modul basiert auf den praktischen Erfahrungen der in Bielefeld
durchgeführten Genom- und Postgenomprojekte. Ziel des Praktikums ist die
eigenständige Entwicklung eines Mini-Genomannotationssystems.
Die folgenden Bereiche sollen abgedeckt werden: Genvorhersage (besonders
Prokaryonten mit einem Seitenblick auf Eukaryonten),
Funktionsvorhersage, Genomannotation (hier besonders verfügbare
Werkzeuge und Datenbanken), komparative Genomanalyse, Speicherung und
Analyse von Expressionsdaten, DNA-Microarrays.

Kompetenzerwerb:

In Ergänzung zu den theoretischen Kenntnissen sollen die Studierenden
die praktische Anwendung der bioinformatischen Methoden im Bereich der
Genomforschung kennenlernen. Neben der Vermittlung von Kenntnissen über
existierende Softwarewerkzeuge und Datenbanken steht die Erstellung
eigener Pipelines zur Datenanalyse im Vordergrund. Das Praktikum endet
mit der Präsentation der Ergebnisse und einer gemeinsamen Bewertung im
Hinblick auf Funktionsumfang und Benutzbarkeit.

Studiengang: BiG-Master, 2. Semester
Modul: Algorithmen in der Genomforschung
Theorie-Teil semesterbegleitend 1 SWS, detaillierte Terminabsprache in einer Vorbesprechung in der ersten Semesterwoche, Ankündigung des
Termins via eKVV E-Mailverteiler

Prüfungsform:
unbenoteter Vortrag und eine abschließende Vorführung der erstellten Software im Praktikum