392160 Computergestützte Analyse von Massenspektren (S) (SoSe 2005)
Kurzkommentar
Inhalt, Kommentar
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Im Rahmen des Seminars soll von den Teilnehmern ein Programm erstellt werden, das die notwendigen Techniken zur Analyse eines Protein Mass Fingerprints (PMF) implementiert. Bekanntester Vertreter eines solchen Analyseprogramms ist das kommerzielle MASCOT-Paket.
PMFs sind eine der weitest verbreiteten Analysetechniken der Proteomik, und werden zur Identifikation von Proteinen durch Massenspektrometrie verwendet: Dabei werden die Proteine separiert, das separierte Protein i.d.R. mit Trypsin verdaut und das resultierende Massenspektrum mit theoretischen, aus einer Proteindatenbank generierten Spektren verglichen.
Das Programm soll:
- an das OpenSource-Projekt OpenMS angebunden werden
- an das Bielefelder Projekt ProDB angebunden werden
- in der Arbeitsgruppe entwickelte Algorithmen zum Alignment von Massenspektren verwenden
- zur Evaluation von "scoring schemes" verwendet werden
Lehrende
Termine ( Kalendersicht )
| Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum |
|---|
Fachzuordnungen
| Studiengang/-angebot | Gültigkeit | Variante | Untergliederung | Status | Sem. | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor | (Einschreibung bis SoSe 2011) | Modul 8; Modul 11 | Wahlpflicht | 6. | 4 | unbenotet | |
| Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Einschreibung bis SoSe 2004) | BioI | HS |
Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein E-Learningangebot vorhanden
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- Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
- Freitag, 11. Dezember 2015
- Letzte Änderung Zeiten:
- Freitag, 3. Dezember 2004
- Letzte Änderung Räume:
- Mittwoch, 9. Februar 2005
- Art(en) / SWS
- Seminar (S) / 2
- Einrichtung
- Technische Fakultät
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