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201061 Bioinformatik in Genomprojekten (Pr+Ü) (SoSe 2003)
Short comment
- Vertiefung; Vorbesprechung am 07.05., 13 c.t., V6-138; FREIE PLÄTZE per 12.2.03 : -9- (Vergabe über die Veranstalter)
Contents, comment
-
Typische Genome enthalten tausende von Genen. Die Auswertung dieser Datenflut ist nur mit bioinformatischen Methoden möglich. Im Rahmen dieses Blocks sollen von den Rohdaten vom Sequenzierautomaten bis zum fertig annotierten Genom alle Arbeitsschritte (zumindest exemplarisch) an einem Beispieldatensatz geübt werden. Dies beinhaltet die folgenden Teilschritte:
- UNIX Grundkenntnisse
- Datenmanagement (mit UNIX-Kommandozeile, das Werkzeug "make")
- Zusammenbau der Einzelsequenzen ("Assembly")
- Bestimmung von potentiellen Genen ("gene prediction")
- Vergleich mit Sequenzdatenbanken ("blast", "pfam")
- Erstellung einer Web-Oberfläche für die gesamten Daten
Die Teilnehmer erhalten die Möglichkeit, alle Arbeitsschritte selbest am Rechner durchzuführen und werden dabei unterstützt. (Rechner = UNIX) Teilnehmerkreis: Hauptstudium, Vorbereitung auf die Diplomarbeit. Scheinkriterien: regelmässige Teilnahme, Vortrag, Protokoll oder Präsentation der eigenen im Rahmen des Blocks entwickelten Lösung. [Lf: n; 50: n; Fs: n]
Teaching staff
Dates ( Calendar view )
| Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period |
|---|
Subject assignments
| Degree programme/academic programme | Validity | Variant | Subdivision | Status | Semester | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Biologie / Diplom | (Enrollment until WiSe 02/03) | f | Wahlpflicht | HS | |||
| Biologie / Lehramt Sekundarstufe I | A2 | Wahl | HS | ||||
| Biologie / Lehramt Sekundarstufe II | A2 | Wahlpflicht | HS | ||||
| Umweltwissenschaften / Diplom | (Enrollment until WiSe 02/03) | f | Wahl | HS |
No more requirements
No eLearning offering available
- Registered number: 1
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- Limitation of the number of participants:
- Limited number of participants: 12
- Address:
- SS2003_201061@ekvv.uni-bielefeld.de
- This address can be used by teaching staff, their secretary's offices as well as the individuals in charge of course data maintenance to send emails to the course participants. IMPORTANT: All sent emails must be activated. Wait for the activation email and follow the instructions given there.
- If the reference number is used for several courses in the course of the semester, use the following alternative address to reach the participants of exactly this: VST_1057516@ekvv.uni-bielefeld.de
- Coverage:
- No students to be reached via email
- Notes:
- Additional notes on the electronic mailing lists
- Last update basic details/teaching staff:
- Friday, December 11, 2015
- Last update times:
- Friday, November 15, 2002
- Last update rooms:
- Friday, November 15, 2002
- Type(s) / SWS (hours per week per semester)
- internship (Pr) + exercise (Ü) / 8+2
- Department
- Faculty of Biology
- Questions or corrections?
- Questions or correction requests for this course?
- Planning support
- Clashing dates for this course
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- ECTS points
- 10
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- ID
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