392134 Vorhersage von regulatorischen Netzwerken (S) (SoSe 2002)

Um die wechselseitigen Beziehungen bzw. das Zusammenspiel aller
Gene eines Organismus zu analysieren, bedient man sich der DNA-Microarray
Technologie. Diese ermöglicht die gleichzeitige Messung der Expression von
über 10000 (bekannten) Genen. In den Experimenten macht man
Zeitreihenanalysen unter verschiedenen Bedingungen.
Nach der Vorverarbeitung der Rohdaten
(Musteranalyse, Normierung), gilt es, zu erkennen

• welche Gene unter welchen Bedingungen exprimiert werden,
• welche Gene unter welchen Bedingungen koreguliert werden,
• welche Gene unter welchen Bedingungen durch andere Gene reguliert

werden etc.

Ultimatives Ziel ist es, aus diesen Daten eine automatische Vorhersage des zu
Grunde liegenden (genetischen) regulatorischen Netzwerkes zu ermöglichen.
Dazu werden die genetischen Netzwerke z.B. durch Boolsche Netzwerke
oder Bayes-Netze modelliert. In dem Seminar werden die ersten Ansätze
in diesem noch sehr jungen Gebiet an Hand von Originalveröffentlichungen
behandelt.

Literaturangaben

diverse Zeitschriftenartikel (in englischer Sprache)

Externe Kommentarseite

http://www.TechFak.Uni-Bielefeld.DE/ags/ai/lehre/S02.html#392134