392189 Algorithms in Comparative Genomics (V) (SoSe 2024)

Inhalt, Kommentar

Many questions in molecular biology, phylogenetics, and biomedicine can be approached through comparison of two or more genomes. However, a global alignment of multiple large genomes is often infeasible or comes at great expense. It is more efficient to compare genomes on a higher level of abstraction, as given by the succession of single-copy genes or other kinds of unique genomic markers on the chromosomal sequences.

In this course, various models of higher level genome comparison are discussed. We start with the classical breakpoint distance, followed by other simple measures such as SCJ and DCJ. The reversal distance will be discussed, and a general genome rearrangement distance. We will also study methods for the reconstruction of ancestral genomes.

Algorithms discussed in this course are mostly combinatorial by nature, similar to the sequence analysis course.

This course is taught in English.

Teilnahmevoraussetzungen, notwendige Vorkenntnisse

Required: Algorithms and Data Structures (or comparable)
Recommended: Sequence Analysis and Foundations of Genome Research

Externe Kommentarseite

https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2024summer/cg

Lehrende

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Fachzuordnungen

Modul Veranstaltung Leistungen  
39-Inf-AB Algorithmen der Bioinformatik Ausgewählte Vorlesung zu Algorithmen der Bioinformatik unbenotete Prüfungsleistung
benotete Prüfungsleistung
Studieninformation
39-Inf-SAB_a Spezielle Algorithmen der Bioinformatik Ausgewählte Vorlesung zu Spezielle Algorithmen der Bioinformatik unbenotete Prüfungsleistung
benotete Prüfungsleistung
Studieninformation
39-Inf-WP-AP Algorithmen & Programmierung (Basis) Einführende Vorlesung Studieninformation
- benotete Prüfungsleistung Studieninformation
39-Inf-WP-AP-x Algorithmen & Programmierung (Schwerpunkt) Einführende Veranstaltung Seminar o. Vorlesung Studieninformation
- benotete Prüfungsleistung Studieninformation
39-Inf-WP-CLS Computational Life Sciences (Basis) Einführende Vorlesung Studieninformation
- benotete Prüfungsleistung Studieninformation
39-Inf-WP-CLS-x Computational Life Sciences (Schwerpunkt) Einführende Veranstaltung Seminar o. Vorlesung Studieninformation
- benotete Prüfungsleistung Studieninformation

Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.


Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein Lernraum vorhanden
registrierte Anzahl: 7
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Adresse:
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E-Mailarchiv
Anzahl der Archiveinträge: 1
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Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Dienstag, 28. November 2023 
Letzte Änderung Zeiten:
Dienstag, 28. November 2023 
Letzte Änderung Räume:
Dienstag, 28. November 2023 
Art(en) / SWS
V / 2
Sprache
Diese Veranstaltung wird komplett in englischer Sprache gehalten
Einrichtung
Technische Fakultät
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Planungshilfen
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449959703