Module 20-AM10 Data Science in Biology

Faculty

Person responsible for module

Regular cycle (beginning)

Every winter semester

Credit points and duration

10 Credit points

For information on the duration of the modul, refer to the courses of study in which the module is used.

Competencies

Das Modul soll in den kritischen Umgang mit biologischen Messdaten sowie in die Nutzung einer Programmiersprache einführen. Dabei erwerben Studierende ein Bewusstsein für die Probleme der Datenerhebung, lernen den Umgang mit verschiedenen Datentypen, werten Daten explorativ und statistisch aus und visualisieren Datensätze zur Beantwortung verschiedener Forschungsfragen. Dies wird anhand einer Reihe von Fallstudien illustriert und geübt. Bei der statistischen Auswertung wird der Fokus stärker auf die Anwendung von Methoden gelegt als auf die Vermittlung theoretischer Grundlagen. Es wird gelernt, einfache Modelle aufzustellen und zu simulieren. Zu den erworbenen Programmierkenntnissen gehören das Einlesen, Auswerten, Visualisieren, Modellieren von Daten sowie der Umgang mit speziellen Bibliotheken und die Erstellung eigener einfacher Programme. Ziel ist es, eine Reihe an universellen Werkzeugen vorzustellen, die für vielfältige Problemstellungen im Rahmen der wissenschaftlichen Forschung und darüber hinaus genutzt werden können.

Content of teaching

Das Erstellen und Auswerten von komplexen Datensätzen ist ein Bestandteil in allen Bereichen der Biologie. Im Rahmen dieses Aufbaumoduls soll der Umgang mit Daten an einem breiten Spektrum biologischer Inhalte geübt und gefestigt werden und so Studierenden Sicherheit bei der Planung, Durchführung und Auswertung wissenschaftlicher Experimente geben. Dazu wird ein Teil der Veranstaltung in Form einer Einführung in eine Programmiersprache (z.B. Python) ablaufen. Diese liefert die Grundlagen für weitere, vertiefende Anwendung in einzelnen Fallstudien, durch die Studierende einen Einblick in das datengestützte, wissenschaftliche Arbeiten erhalten sollen. Sie nutzen die Sprache dabei sowohl als Analysewerkzeug als auch als Mittel, um Daten zu simulieren, Modelle zu erstellen und eigene Programme zu schreiben. Die Fallstudien decken dabei in der Regel jeweils den gesamten Weg von Fragestellung über Datenaufnahme und -management bis hin zur Auswertung und Präsentation ab. In eigenen Datenanalyse-Projekten wenden die Studierenden die gewonnenen Fähigkeiten dann an, um eine eigene Fragestellung zu beantworten.

Recommended previous knowledge

20-BM_b Mathematik, Teil Statistik/Informatik

Necessary requirements

Explanation regarding the elements of the module

Module structure: 1 SL, 1 bPr 1

Courses

Data Science in der Biologie
Type exercise
Regular cycle WiSe
Workload5 300 h (120 + 180)
LP 10 [SL]

Study requirements

Allocated examiner Workload LP2
Teaching staff of the course Data Science in der Biologie (exercise)

Eigenständige Vorbereitung auf die Kurstage durch bereitgestellte Materialien, der Bearbeitung von kurzen (Selbst-)Tests zur Lernstandskontrolle sowie der Durchführung und Dokumentation der Versuche samt Datenauswertung und -präsentation in Gruppen.

see above see above

Examinations

project with written assignment
Allocated examiner Person responsible for module is examiner
Weighting 1
Workload -
LP2 -

Die Abschlussprüfung besteht aus der eigenständigen Durchführung eines Data-Science-Projektes und Darstellung der Durchführung und Ergebnisse in Form eines wissenschaftlichen Berichtes von maximal zehn Seiten, inkl. Bereitstellung der für die Auswertung verwendeten Programme im Quelltext. Die Note wird aus der Bewertung des Berichts ermittelt.

The module is used in these degree programmes:

Degree programme Version Profile Recom­mended start 3 Duration Manda­tory option 4
Biology / Bachelor of Science [FsB vom 17.08.2015 mit Berichtigung vom 05.10.2015 und Änderungen vom 30.09.2016, 01.04.2019, 01.10.2020, 14.01.2022 und 28.02.2025] Bachelor with One Core Subject (Academic) Genetics, Cell Biology, Physiology 5. one semester Compul­sory optional subject
Biology / Bachelor of Science [FsB vom 17.08.2015 mit Berichtigung vom 05.10.2015 und Änderungen vom 30.09.2016, 01.04.2019, 01.10.2020, 14.01.2022 und 28.02.2025] Bachelor with One Core Subject (Academic) Behaviour and Neural Mechanisms 5. one semester Compul­sory optional subject
Biology / Bachelor of Science [FsB vom 17.08.2015 mit Berichtigung vom 05.10.2015 und Änderungen vom 30.09.2016, 01.04.2019, 01.10.2020, 14.01.2022 und 28.02.2025] Bachelor with One Core Subject (Academic) Ecology and Diversity 5. one semester Compul­sory optional subject
Biology / Bachelor of Science [FsB vom 17.08.2015 mit Berichtigung vom 05.10.2015 und Änderungen vom 30.09.2016, 01.04.2019, 01.10.2020, 14.01.2022 und 28.02.2025] Major Subject (Academic) 5. one semester Compul­sory optional subject
Biology - Courses offered for the Individual Subsidiary Subjects / Individueller Ergänzungsbereich im Bachelor 1. o. 2. o. 3. o. 4. o. 5. o. 6. one semester Compul­sory optional subject
Courses offered for the Individual Subsidiary Subjects / Individueller Ergänzungsbereich im Bachelor Fakultät für Biologie 1. o. 2. o. 3. o. 4. o. 5. o. 6. one semester Compul­sory optional subject
Courses offered for the Individual Subsidiary Subjects - Topics / Individuelle Ergänzung im Bachelor Digitalisierung Fachspezifische Verfahren und Kompetenzen 1. o. 2. o. 3. o. 4. o. 5. o. 6. one semester Compul­sory optional subject

Automatic check for completeness

The system can perform an automatic check for completeness for this module.


Legend

1
The module structure displays the required number of study requirements and examinations.
2
LP is the short form for credit points.
3
The figures in this column are the specialist semesters in which it is recommended to start the module. Depending on the individual study schedule, entirely different courses of study are possible and advisable.
4
Explanations on mandatory option: "Obligation" means: This module is mandatory for the course of the studies; "Optional obligation" means: This module belongs to a number of modules available for selection under certain circumstances. This is more precisely regulated by the "Subject-related regulations" (see navigation).
5
Workload (contact time + self-study)
SoSe
Summer semester
WiSe
Winter semester
SL
Study requirement
Pr
Examination
bPr
Number of examinations with grades
uPr
Number of examinations without grades
This academic achievement can be reported and recognised.