Module 39-M-MBT9P_b Specialization module in Proteomics (Laboratory)

Faculty

Person responsible for module

Regular cycle (beginning)

Every winter semester

Credit points and duration

5 Credit points

For information on the duration of the modul, refer to the courses of study in which the module is used.

Competencies

Das Praktikum schult die experimentellen Fertigkeiten, indem die im zugeordneten Theriemodul erlernten Inhalte zu Proteomanalysen praktisch angewandt werden. Die Studierenden sollen dadurch befähigt werden, Techniken der Proteomanalyse selbständig ausführen zu können. Die praktische Anwendung der erworbenen Fähigkeiten wird in Form eines Portfolios erarbeitet.

Content of teaching

Das Praktikum führt in grundlegende Techniken und Auswertestrategien der Proteomanalyse ein. Als Modell dienen Zellkulturen, bei denen starke Veränderungen des Proteininventars zu erwarten sind, z.B. durch die Induktion des Programmierten Zelltods. Dazu werden den Studierenden Proben gestellt, die aus einem differenziellen Versuchsansatz stammen, von denen in einer der beiden Kulturen eine Veränderung induziert wurde. Die Studierenden ernten Zellen der beiden Kulturen, um Gesamtprotein- und fraktionierte Protein-Extrakte für Proteomanalysen zu generieren. In 2DE-Gel-Ansätzen werden die Proteinspot-Muster der behandelten und unbehandelten Zellen verglichen. Nach einer Software-Auswertung der Gele (Delta2D) sollen exemplarisch differenziell exprimierte Spots aus den Gelen präpariert, tryptisch verdaut und mit MALDI-MS identifiziert werden. Parallel dazu werden die Proben mit SDS-PAGE getrennt und Banden mittels NanoLC-ESI-MS/MS identifiziert. Weiterhin werden im Praktikum manuelle MSMS-Analysen von Peptiden durchgeführt, sowie Einblicke in die DIGE-Methode und die Verwendung von Proteom-Datenbanken (u.a. QuPE) gegeben.

Recommended previous knowledge

Necessary requirements

Vorausgesetzte Module:
39-M-MBT9T: Spezialisierung Prozessmesstechnik, Analytik und spezielle Messmethoden Theorie

Explanation regarding the elements of the module

Module structure: 1 uPr 1

Courses

Praktikum Proteomanalyse tierischer Zelllinien
Type internship
Regular cycle WiSe
Workload5 150 h (90 + 60)
LP 5 [Pr]

Examinations

portfolio
Allocated examiner Teaching staff of the course Praktikum Proteomanalyse tierischer Zelllinien (internship)
Weighting without grades
Workload -
LP2 -

Portfolio aus einem Versuch zur Proteomanalyse.
Der Versuch besteht aus:

  • Überprüfung der Vorkenntnisse (Antestat)
  • Versuchsdurchführung und Protokollierung von Beobachtungen und Ergebnissen
  • Anfertigen und Abgabe eines schriftlichen Versuchsprotokolls
  • Gespräch über das Versuchsprotokoll (Abtestat)

The module is used in these degree programmes:

Degree programme Recom­mended start 3 Duration Manda­tory option 4
Molecular Biotechnology / Master of Science [FsB vom 01.07.2022 mit Änderung vom 31.03.2023] 1. o. 3. one semester Compul­sory optional subject
Molecular Biotechnology / Master of Science [FsB vom 17.12.2012 mit Änderungen vom 01.08.2013, 02.03.2015, 30.09.2016 und 02.07.2018] 1. o. 3. one semester Compul­sory optional subject

Automatic check for completeness

The system can perform an automatic check for completeness for this module.


Legend

1
The module structure displays the required number of study requirements and examinations.
2
LP is the short form for credit points.
3
The figures in this column are the specialist semesters in which it is recommended to start the module. Depending on the individual study schedule, entirely different courses of study are possible and advisable.
4
Explanations on mandatory option: "Obligation" means: This module is mandatory for the course of the studies; "Optional obligation" means: This module belongs to a number of modules available for selection under certain circumstances. This is more precisely regulated by the "Subject-related regulations" (see navigation).
5
Workload (contact time + self-study)
SL
Study requirement
Pr
Examination
bPr
Number of examinations with grades
uPr
Number of examinations without grades
Diese Leistung kann gemeldet und verbucht werden.