392167 Bioinformatische Anwendungen in der Genomforschung (Pr) (SoSe 2007)

In diesem Modul werden praktische Anwendungen und Problemstellungen beim Einsatz bioinformatischer Techniken in der Genomforschung behandelt. Das Modul basiert auf den praktischen Erfahrungen der in Bielefeld durchgeführten Genom- und Postgenomprojekte. Ziel des Praktikums ist die eigenständige Entwicklung eines Mini-Genomannotationssystems.
Die folgenden Bereiche sollen abgedeckt werden: Genvorhersage (besonders Prokaryonten mit einem Seitenblick auf Eukaryonten), Funktionsvorhersage, Genomannotation (hier besonders verfügbare Werkzeuge und Datenbanken), komparative Genomanalyse, Speicherung und Analyse von Expressionsdaten, DNA-Microarrays.

Kompetenzerwerb:
In Ergänzung zu den theoretischen Kenntnissen sollen die Studierenden die praktische Anwendung der bioinformatischen Methoden im Bereich der Genomforschung kennenlernen. Neben der Vermittlung von Kenntnissen über existierende Softwarewerkzeuge und Datenbanken steht die Erstellung eigener Pipelines zur Datenanalyse im Vordergrund. Das Praktikum endet mit der Präsentation der Ergebnisse und einer gemeinsamen Bewertung im Hinblick auf Funktionsumfang und Benutzbarkeit.