In dem Praktikum soll eine biologisch motivierte Anwendungsstudie zu RNAs und ihren Funktionen durchgeführt werden. Dabei wird, soweit möglich unter Einsatz aktueller Werkzeuge, nach regulatorischen Motiven in genomischen Sequenzen gesucht. Falls die vorhandenen Methoden nicht ausreichen, sollen die notwendigen Werkzeuge selber (weiter-)entwickelt werden.
Der Besuch der parallel stattfindenden Veranstaltung "RNA structure prediction and comparison" wird dringend empfohlen.
In dem Praktikum werden verschiedene etablierte Bioinformatik Werkzeuge (Blast, RNAfold, Infernal, ...) auf Kommandozeile verwendet. Hierzu sind Kenntnisse von Perl oder einer aequivalenten Scriptsprache notwendig.
Frequency | Weekday | Time | Format / Place | Period |
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Module | Course | Requirements | |
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39-M-Inf-RNA Bioinformatik der RNA | Erkennung regulativer Motive | Graded examination
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Student information |
The binding module descriptions contain further information, including specifications on the "types of assignments" students need to complete. In cases where a module description mentions more than one kind of assignment, the respective member of the teaching staff will decide which task(s) they assign the students.
Degree programme/academic programme | Validity | Variant | Subdivision | Status | Semester | LP | |
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Bioinformatik und Genomforschung / Master | (Enrollment until SoSe 2012) | Vertiefung Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 1. | unbenotet LP s. Vorlesung | ||
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Enrollment until SoSe 2004) | allgem.HS; BioI | Teilleistung mündliche Prüfung möglich HS | ||||
Naturwissenschaftliche Informatik / Master | (Enrollment until SoSe 2012) | Vertiefung Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 1. | unbenotet LP s. Vorlesung |