209618 Forschungsmodul I: Methoden zur zellbiologischen Charakterisierung der Struktur und Funktion von Proteien und Enyzmkomplexen der Pflanzenteile (V+Pr) (WiSe 2010/2011)

Das Forschungsmodul I erlaubt den Studierenden vertiefende Einblicke in das Forschungsumfeld des Lehrstuhls für Biochemie und Physiologie der Pflanzen. Jeder Teilnehmer erhält ein eigenes Thema zur Bearbeitung, das an aktuelle Forschungsinteressen des Lehrstuhls angelehnt ist. Im Verlauf des Moduls wird diese Aufgabenstellung unter Anleitung erfahrener Experimentatoren, aber möglichst selbständig bearbeitet, wobei ein am Lehrstuhl etabliertes Methodenspektrum erlernt und selbständig angewandt werden soll. Dabei sind vielfältige biochemische Verfahren und Aktivitätstests (z.B.Messung der ATPase-Aktivität, Nachweis von Glutathionylierung und Nitrosylierung) und Analysen physiologischer Parameter (z.B. Ascorbat-, ATP-Gehalt) möglich. Darüber hinaus umfasst das Methodenspektrum der Arbeitsgruppe u.a. die Analyse des Transkriptspiegels (RT-PCR, Realtime-PCR und Macro-Arrays), der Promotoraktivität (Luciferase, GFP und GUS-Reportergenassays) sowie die Analyse der DNA-Protein-Interaktion von Transkriptionsfaktoren (Yeast-1-Hybrid, Transaktivitierungsansätze, EMSA). Neue Techniken finden Verwendung für den Nachweis von Protein-Protein-Interaktionen (Isothermale Mikrokalorimetrie ITC, Fluoreszenz Resonanz Energie Transfer FRET, bimolecular fluorescence complementation BiFC) und werden durch biochemische Methoden gestützt (Immunpräzipation, Crosslinking, Yeast-2-Hybrid). Eine in vivo Charakterisierung von Proteinen wird durch die Erzeugung von knockout bzw. RNAi-, Überexpressions- oder Reportergen-Linien ermöglicht.