Every winter semester
5 Credit points
For information on the duration of the modul, refer to the courses of study in which the module is used.
Die Studierenden besitzen Kenntnisse zu den wichtigsten bioinformatischen Datenbanken und -ressourcen und können diese praktisch zur Beantwortung von Forschungsfragen und zur Recherche nach biologischem Wissen nutzen. Sie können darüber hinaus verschiedene Datenbanken qualitativ bewerten und verstehen, welche Datensammlungen für spezifische Einsatzzwecke geeignet sind, um fundierte bioinformatische Analysen durchführen zu können, wissenschaftliche Entdeckungen zu unterstützen und zur Lösung komplexer biologischer Fragen beizutragen. Dies beinhaltet nicht nur Kenntnisse über die Datenbanken selbst, sondern ebenso über Datenformate sowie insbesondere Softwarewerkzeuge und APIs zu Suche, Extraktion und Aufbereitung der Daten.
Bioinformatische Datenbanken sind Sammlungen von biologischen Informationen wie genetischen Sequenzen, Proteinstrukturen, metabolischen Stoffwechselwegen und experimentellen Ergebnissen. Sie stellen eine wertvolle und unerlässliche Ressource für Forschende dar, um biologische und medizinische Fragestellungen zu beantworten, neue Erkenntnisse zu gewinnen und auch bioinformatische Anwendungen zu entwickeln. Beispiele für solche Datenbanken umfassen: GenBank und ENA für genetische Sequenzen von verschiedenen Organismen, UniProt für Informationen zu Proteinen, Reactome und KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) für metabolische Stoffwechselwege, Protein Data Bank (PDB) für Strukturdaten zu biologischen Molekülen oder SRA, PRIDE und ArrayExpress als Repositorien für experimentelle Daten.
Inhalt des Moduls ist die Vermittlung von theoretischen Kenntnissen zu den wichtigsten Datenbanken der Bioinformatik sowie zur praktischen Nutzung dieser Datenressourcen in Hinblick auf die Recherche, Extraktion und Integration von Daten zur qualifizierten Beantwortung von Forschungsfragen und zur Gewinnung neuer Erkenntnisse.
Auch in den Übungen werden dazu grundlegende Kenntnisse erworben.
In der schriftlichen oder mündlichen Prüfung werden die theoretischen Kenntnisse und die Fähigkeit zur Verallgemeinerung und Einordnung in das Zusammenhangswissen geprüft.
Grundlegende Kenntnisse der Programmierung und grundlegende Kenntnisse der Molekularbiologie.
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Module structure: 1 bPr 1
Portfolio mit Abschlussprüfung bestehend aus:
1) Portfolio von Übungen zu Inhalten der Vorlesung
Übungsaufgaben, die veranstaltungsbezogen gestellt werden (Bestehensgrenze 50% der erzielbaren Punkte). Die Kontrolle der Übungsaufgaben umfasst auch direkte Fragen zu den Lösungsansätzen, die von den Studierenden in den Übungen beantwortet werden müssen. Der*die Lehrende kann ein individuelles Erläutern und Vorführen von Aufgaben verlangen sowie einen Teil der Übungsaufgaben durch Präsenzübungen ersetzen. Die Übungsaufgaben im Rahmen des Portfolios werden in der Regel wöchentlich ausgegeben und dienen dem begleitenden Erlernen selbständiger Umsetzungen der in der Vorlesung vorgestellten Lerninhalte.
2) Abschlussprüfung zur Vorlesung
Die Abschlussprüfung zu den Inhalten der Vorlesung nimmt Bezug auf die Übungsaufgaben oder entwickelt sich aus den in den Übungen erlernten Kompetenzen. Es handelt sich um eine Abschlussklausur (im Umfang von ca. 90 Minuten) oder um eine mündliche Abschlussprüfung (im Umfang von ca. 15 -25 Minuten).
Die Klausur kann alternativ als eKlausur, Open Book Klausur oder eOpen Book Klausur geprüft werden. Im Falle von Open Book Klausur und eOpen Book Klausur beträgt der Umfang 120-180 Minuten.
Beide Portfolioelemente werden durch je eine*n Prüfer*in geprüft. Es erfolgt eine abschließende Gesamtbewertung.
| Degree programme | Version | Recommended start 3 | Duration | Mandatory option 4 |
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| Bioinformatic Genome Research / Bachelor of Science [FsB vom 28.03.2024] | Bachelor with One Core Subject (Academic) | 4. | one semester | Obligation |
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