Every summer semester
10 Credit points
For information on the duration of the modul, refer to the courses of study in which the module is used.
Den Studierenden werden die theoretischen Grundlagen der Sequenzanalyse vermittelt, sie lernen die gängigen Werkzeuge kennen und sammeln praktische Erfahrung mit diesen Werkzeugen.
Students learn theoretical fundamentals of sequence analysis, get to know common tools and gain practical experience in using these.
In diesem Modul werden die gängigen Techniken der Sequenzanalyse behandelt: Exakte und approximative Textsuche, paarweises und multiples Alignment, Datenstrukturen zur Indizierung von Texten, Werkzeuge zur schnellen Sequenzdatenbanksuche.
This module covers common techniques in sequence analysis: Exact and approximative string matching, pairwise and multiple alignment, text index datastructures, tools for fast database search.
39-Inf-AD Grundlagen der Algorithmen und Datenstrukturen
Erfolgreicher Abschluss des Moduls 39-Inf-1: Algorithmen und Datenstrukturen oder 39-Inf-PP Prinzipien der Programmierung
Module structure: 1 SL, 1 bPr 1
Allocated examiner | Workload | LP2 |
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Teaching staff of the course
Sequenzanalyse-Praktikum
(tutorial (in connection with lecture/seminar))
Bearbeitung von Praktikumsaufgaben (Literaturarbeit, Programmierung, Datenanalyse) mit anschließender Anfertigung eines Ergebnisprotokolls, Referat (30 - 45 Minuten) mit Ausarbeitung (5 - 10 Seiten). Attending to practical assignments (literature research, programming, data analysis) including |
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Portfolio mit Abschlussprüfung bestehend aus:
1) Portfolio von Übungen zu Inhalten der Vorlesung
Übungsaufgaben oder Programmieraufgaben, die veranstaltungsbezogen gestellt werden (Bestehensgrenze 50% der erzielbaren Punkte). Die Kontrolle der Übungsaufgaben umfasst auch direkte Fragen zu den Lösungsansätzen, die von den Studierenden in den Übungen beantwortet werden müssen. Der*die Lehrende kann ein individuelles Erläutern und Vorführen von Aufgaben verlangen (zweimaliges Vorrechnen von Übungsaufgaben nach Aufforderung) sowie einen Teil der Übungsaufgaben durch Präsenzübungen ersetzen. Die Übungsaufgaben im Rahmen des Portfolios werden in der Regel wöchentlich ausgegeben und dienen dem begleitenden Erlernen selbständiger Umsetzungen der in der Vorlesung vorgestellten Lerninhalte.
2) einer Abschlussprüfung zur Vorlesung
Die Abschlussprüfung zu den Inhalten der Vorlesung nimmt Bezug auf die Übungs- oder Programmieraufgaben oder entwickelt sich aus den in den Übungen erlernten Kompetenzen.
Eine weitergehende Konkretisierung insbesondere zum zeitlichen Umfang der Abschlussprüfung erfolgt in der Beschreibung der Veranstaltung.
Abschlussklausur (im Umfang von ca. 90 Minuten) oder mündliche Abschlussprüfung (im Umfang von ca. 15 -25 Minuten) zu den in der Vorlesung vermittelten und in den Übungen erarbeiteten Inhalten.
Die Klausur kann alternativ als eKlausur, Open Book Klausur oder eOpen Book Klausur geprüft werden. Im Falle von Open Book Klausur und eOpen Book Klausur beträgt der Umfang 120-180 Minuten.
Beide Portfolioelemente werden durch eine*n Prüfer*in geprüft. Es erfolgt eine abschließende Gesamtbewertung.
Portfolio of homework assignments accompanying the lecture, usually given weekly, and final written exam (90 min) or oral exam (15 - 25 min). The assignments complement and deepen the content of the lecture.
Participation in the tutorials (explaning solutions of assignments twice upon request). The lecturer may replace parts oft he homework assignments by attendance assignments. Proof of a sufficient amount of correctly solved assignments (usually 50% of the maximum total score in the semester). The final exam covers the content of the lecture and the assignments, and serves for grading. The lecturer announces at the beginning oft he lecture whether the module is concluded by a written or an oral exam.
Degree programme | Version | Profile | Recommended start 3 | Duration | Mandatory option 4 |
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Bioinformatics and Genome Research / Bachelor of Science [FsB vom 30.09.2016 mit Änderungen vom 15.09.2017, 02.05.2018, 01.07.2019 und 16.08.2021] | Bachelor with One Core Subject (Academic) | 2. | two semesters | Obligation | |
Bioinformatics and Genome Research / Master of Science [FsB vom 30.09.2016 mit Änderungen vom 15.09.2017, 02.05.2018, 04.06.2020 und 31.03.2023] | 1. | two semesters | Compulsory optional subject | ||
Informatics / Bachelor of Science [FsB vom 16.05.2023 mit Änderung vom 01.08.2023] | Major Subject (Academic) | Bioinformatics | 3. | two semesters | Obligation |
Informatics / Bachelor [FsB vom 16.05.2023 mit Änderung vom 01.08.2023] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Practical Informatics | 3. o. 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Informatics / Bachelor [FsB vom 16.05.2023 mit Änderung vom 01.08.2023] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Technical Informatics | 3. o. 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Informatics / Bachelor of Science [FsB vom 04.06.2020 mit Änderung vom 15.12.2021] | Major Subject (Academic) | Bioinformatics | 2. | two semesters | Obligation |
Informatics / Bachelor [FsB vom 04.06.2020 mit Änderung vom 15.12.2021] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Practical Informatics | 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Informatics / Bachelor [FsB vom 04.06.2020 mit Änderung vom 15.12.2021] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Technical Informatics | 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Informatics / Bachelor [FsB vom 30.09.2016 mit Änderungen vom 15.09.2017, 02.05.2018, 15.11.2019 und 16.08.2021] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Practical Informatics | 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Informatics / Bachelor [FsB vom 30.09.2016 mit Änderungen vom 15.09.2017, 02.05.2018, 15.11.2019 und 16.08.2021] | Minor Subject (Academic), 60 CPs | Technical Informatics | 5. | two semesters | Compulsory optional subject |
Interdisciplinary Biomedicine / Master of Science [FsB vom 02.07.2018 mit Änderungen vom 16.05.2023 und 28.03.2024] | Bioinformatics | 2. | two semesters | Compulsory optional subject | |
Interdisciplinary Biomedicine / Master of Science [FsB vom 02.07.2018 mit Änderungen vom 16.05.2023 und 28.03.2024] | Health Science | 2. | two semesters | Compulsory optional subject | |
Informatics for the Natural Sciences / Master of Science [FsB vom 30.09.2016 mit Berichtigung vom 10.01.2017 und Änderungen vom 15.09.2017, 02.05.2018, 04.06.2020 und 31.03.2023] | 2. | two semesters | Compulsory optional subject |
The system can perform an automatic check for completeness for this module.
Bioinformatics and Genome Research / Master of Science
Informatics / Bachelor of Science: Major Subject (Academic) // Bioinformatics
Informatics / Bachelor: Minor Subject (Academic), 60 CPs // Practical Informatics
Informatics / Bachelor: Minor Subject (Academic), 60 CPs // Technical Informatics
Interdisciplinary Biomedicine / Master of Science // Bioinformatics
Interdisciplinary Biomedicine / Master of Science // Health Science