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392218 Cell Screener 2.0 (Pj) (WiSe 2010/2011)

Inhalt, Kommentar

In diesem Projekt sollen Studenten der Biologie, Systembiologie, Bioinformatik, Biotechnologie, etc zusammen Methoden entwickeln, um Infektionsprozesse auf mikroskopischer Ebene mittels Immunifluoreszenz-Labeling zu untersuchen. Auf der Seite der Biologie / Systembiologie soll durch experimentelle Laborarbeit ein Bilddatensatz erstellt und annotiert werden. Entscheidend ist dabei eine enge Kooperation mit den InformatikerInnen, um die semantische Interpretation der Daten zu automatisieren. Auf der Seite der Informatik sollen Verfahren entwickelt und imlementiert werden, um Zellen/Strukturen in denFluoreszenzmikroskopiedaten zu segmentieren und zu klassifizieren. Dabei sollen sowohl klassische Methoden der digitalen Bildverarbeitung als auch maschinelle Lernverfahren zum Einsatz kommen. Besonderer Schwerpunkt liegt in der bequemen späteren Nutzbarkeit der Lösung im Labor. So soll das System in einer client-server Struktur entwickelt werden, so dass es möglichst einfach durch ein webinterface bedient werden kann.

Lehrende

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Klausuren

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik und Genomforschung / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Wahlpflicht Bioinformatik Wahl 5. 10 unbenotet  
Bioinformatik und Genomforschung / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Projekt Bioinformatik Wahlpflicht 3. 10 unbenotet  
Genome Based Systems Biology / Master (Einschreibung bis SoSe 2012)    
Medienwissenschaft, interdisziplinäre / Master (Einschreibung bis SoSe 2014) Modul 4 Wahlpflicht 3. 10 unbenotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Bachelor (Einschreibung bis SoSe 2011) Individueller Ergänzungsbereic Wahl 5. 10 unbenotet  
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom (Einschreibung bis SoSe 2004) allgem.HS   HS
Naturwissenschaftliche Informatik / Master (Einschreibung bis SoSe 2012) Projekt I; Projekt II Wahlpflicht 3. 10 unbenotet  
Konkretisierung der Anforderungen
Keine Konkretisierungen vorhanden
Lernraum
TeilnehmerInnen
Automatischer E-Mailverteiler der Veranstaltung
Änderungen/Aktualität der Veranstaltungsdaten
Sonstiges