201055 Angewandte Bioinformatik (Pr+Ü) (SoSe 2004)

Kurzkommentar

Vertiefung; Vorbesprechung am 19.05., 13 c.t., V6-138;

Inhalt, Kommentar

Typische Genome enthalten tausende von Genen. Die Auswertung dieser Datenflut ist nur mit bioinformatischen Methoden möglich. Im Rahmen dieses Blocks sollen von den Rohdaten vom Sequenzierautomaten bis zum fertig annotierten Genom alle Arbeitsschritte (zumindest exemplarisch) an einem Beispieldatensatz geübt werden. Dies beinhaltet die folgenden Teilschritte:

  • UNIX Grundkenntnisse
  • Datenmanagement (mit UNIX-Kommandozeile, das Werkzeug "make")
  • Zusammenbau der Einzelsequenzen ("Assembly")
  • Bestimmung von potentiellen Genen ("gene prediction")
  • Vergleich mit Sequenzdatenbanken ("blast", "pfam")
  • Erstellung einer Web-Oberfläche für die gesamten Daten

Die Teilnehmer erhalten die Möglichkeit, alle Arbeitsschritte selbest am Rechner durchzuführen und werden dabei unterstützt. (Rechner = UNIX) Teilnehmerkreis: Hauptstudium, Vorbereitung auf die Diplomarbeit. Scheinkriterien: regelmässige Teilnahme, Vortrag, Protokoll oder Präsentation der eigenen im Rahmen des Blocks entwickelten Lösung. [Lf: n; 50: n; Fs: n]

Lehrende

Termine ( Kalendersicht )

Rhythmus Tag Uhrzeit Format / Ort Zeitraum  
Block Block unveröffentlicht 19.04.-30.07.2004

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Fachzuordnungen

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Biologie / Diplom (Einschreibung bis WiSe 02/03) f+g Wahlpflicht HS
Biologie / Lehramt Sekundarstufe I A2 Wahl HS
Biologie / Lehramt Sekundarstufe II A2+B3 Wahlpflicht HS
Umweltwissenschaften / Diplom (Einschreibung bis WiSe 02/03) f+g Wahl HS

Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein E-Learningangebot vorhanden
registrierte Anzahl: 0
Dies ist die Anzahl der Studierenden, die die Veranstaltung im Stundenplan gespeichert haben. In Klammern die Anzahl der über Gastaccounts angemeldeten Benutzer*innen.
Teilnahmebegrenzung:
Begrenzte Anzahl Teilnehmer*innen: 12
Adresse:
SS2004_201055@ekvv.uni-bielefeld.de
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Falls die Belegnummer mehrfach im Semester verwendet wird können Sie die folgende alternative Verteileradresse nutzen, um die Teilnehmer*innen genau dieser Veranstaltung zu erreichen: VST_1084695@ekvv.uni-bielefeld.de
Reichweite:
Keine Studierenden per E-Mail erreichbar
Hinweise:
Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Freitag, 11. Dezember 2015 
Letzte Änderung Zeiten:
Donnerstag, 13. November 2003 
Letzte Änderung Räume:
Donnerstag, 13. November 2003 
Art(en) / SWS
Praktikum (Pr) + Übung (Ü) / 8+2
Einrichtung
Fakultät für Biologie
Fragen oder Korrekturen?
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Planungshilfen
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ECTS Punkte
10
(Siehe auch die LP-Angaben bei den Fachzuordnungen)
ID
1084695