392151 Anwendungen in der Genomforschung (Pr) (SoSe 2005)
Kurzkommentar
- Vorbespr.: 09.03., 14 c.t., V6-138 Anmeldungen per email an fm@cebitec.uni-bielefeld.de
Inhalt, Kommentar
-
Typische Genome enthalten Tausende von Genen. Die Auswertung dieser Datenflut ist nur mit bioinformatischen Methoden möglich. Im Rahmen dieses Blocks sollen von den Rohdaten vom Sequenzierautomaten bis zum fertig annotierten Genom alle Arbeitsschritte (zumindest exemplarisch) an einem Beispieldatensatz geübt werden. Dies beinhaltet die folgenden Teilschritte:
- UNIX Grundkenntnisse
- Datenmanagement (mit UNIX-Kommandozeile, das Werkzeug "make")
- Zusammenbau der Einzelsequenzen ("Assembly")
- Bestimmung von potentiellen Genen ("gene prediction")
- Vergleich mit Sequenzdatenbanken ("blast", "pfam")
- Erstellung einer Web-Oberfläche für die gesamten Daten
Die Teilnehmer erhalten die Möglichkeit, alle Arbeitsschritte selbest am Rechner durchzuführen und werden dabei unterstützt. (Rechner = UNIX) Teilnehmerkreis: Hauptstudium, Vorbereitung auf die Diplomarbeit. Scheinkriterien: regelmäßige Teilnahme, Vortrag, Protokoll oder Präsentation der eigenen im Rahmen des Blocks entwickelten Lösung.
Externe Kommentarseite
Lehrende
Termine ( Kalendersicht )
| Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum | |
|---|---|---|---|---|---|
| wöchentlich | Mi | ab 14:00 | V6-116 | 14.03.-08.04.2005 | Vorbesprechung Mi 9.3.2005, 14h c.t. in V6-138 (Beginn für Biologen am 14.3., für Informatiker am 21.3.05) |
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Fachzuordnungen
| Studiengang/-angebot | Gültigkeit | Variante | Untergliederung | Status | Sem. | LP | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bioinformatik und Genomforschung / Master | (Einschreibung bis SoSe 2012) | Algorithmen in der Genom | Wahlpflicht | 2. | 5 | unbenotet | |
| Molekulare Biotechnologie / Diplom | (Einschreibung bis SoSe 2004) | HS | |||||
| Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Einschreibung bis SoSe 2004) | BioI | Teilleistung mündliche Prüfung möglich HS |
Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein E-Learningangebot vorhanden
- registrierte Anzahl: 3
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- Falls die Belegnummer mehrfach im Semester verwendet wird können Sie die folgende alternative Verteileradresse nutzen, um die Teilnehmer*innen genau dieser Veranstaltung zu erreichen: VST_1117569@ekvv.uni-bielefeld.de
- Reichweite:
- Keine Studierenden per E-Mail erreichbar
- Hinweise:
- Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
- Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
- Freitag, 11. Dezember 2015
- Letzte Änderung Zeiten:
- Montag, 14. Februar 2005
- Letzte Änderung Räume:
- Freitag, 26. November 2004
- Art(en) / SWS
- Praktikum (Pr) / 6
- Einrichtung
- Technische Fakultät
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