392032 Metabolic network analysis (BS) (SoSe 2017)

Inhalt, Kommentar

This short course will provide an overview of metabolic network
analysis, a topic at the intersection of computational biology, systems
biology and mathematical modelling. It will go into detail into the
modeling and analysis of metabolic networks in the constraint-based
formalism, which complement metabolomics data analysis. By the end of
the course the students will have an appreciation for the advantages and
shortcomings of metabolic network models, the tools used for their
analysis, and the open problems currently facing the field. They will
also learn the use of Mongoose, an open-source metabolic network
analysis platform (mongoose.csail.mit.edu).

Tentative Schedule

Day 1: Metabolic network analysis formalisms

topological analysis and deficiency zero theorem
biochemical systems analysis and control theory
constraint-based formalism and flux balance analysis

Day 2: Structural analysis of metabolic network models

blocked reactions classification
enzyme and isozyme subsets
redundant constraint identification

Day 3: Troubleshooting metabolic network models

unblocking blocked reactions
identifying and correcting “free lunches”
network reconciliation and refinement

Day 4: Extensions

inclusion of thermodynamic constraints
metabolic engineering applications
enumeration of elementary modes and minimal cut sets

Lehrende

Termine ( Kalendersicht )

Rhythmus Tag Uhrzeit Format / Ort Zeitraum  

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Fachzuordnungen

Modul Veranstaltung Leistungen  
39-Inf-MIKE Modularisierter individueller Kompetenz-Erwerb (MiKE) - unbenotete Prüfungsleistung Studieninformation
39-M-Inf-MIKE Modularisierter individueller Kompetenz-Erwerb (MiKE) - unbenotete Prüfungsleistung Studieninformation
39-M-MBT-MIKE Modularisierter individueller Kompetenz-Erwerb (MiKE) - unbenotete Prüfungsleistung Studieninformation

Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.

Studiengang/-angebot Gültigkeit Variante Untergliederung Status Sem. LP  
Bioinformatik / Promotion Lecture/seminar Wahl 1 unbenotet Graduierte

Keine Konkretisierungen vorhanden
Kein Lernraum vorhanden
registrierte Anzahl: 7
Dies ist die Anzahl der Studierenden, die die Veranstaltung im Stundenplan gespeichert haben. In Klammern die Anzahl der über Gastaccounts angemeldeten Benutzer*innen.
Adresse:
SS2017_392032@ekvv.uni-bielefeld.de
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Falls die Belegnummer mehrfach im Semester verwendet wird können Sie die folgende alternative Verteileradresse nutzen, um die Teilnehmer*innen genau dieser Veranstaltung zu erreichen: VST_92130672@ekvv.uni-bielefeld.de
Reichweite:
4 Studierende direkt per E-Mail erreichbar
Hinweise:
Weitere Hinweise zu den E-Mailverteilern
Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Mittwoch, 25. Januar 2017 
Letzte Änderung Zeiten:
Mittwoch, 25. Januar 2017 
Letzte Änderung Räume:
Mittwoch, 25. Januar 2017 
Art(en) / SWS
BS / 2
Einrichtung
Technische Fakultät
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92130672
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