392189 Algorithms in Comparative Genomics (V) (WiSe 2021/2022)

Inhalt, Kommentar

Many questions in molecular biology, phylogenetics, and biomedicine can be approached through comparison of two or more genomes. However, a global alignment of multiple large genomes is often infeasible or comes at great expense. It is more efficient to compare genomes on a higher level of abstraction, as given by the succession of single-copy genes or other kinds of unique genomic markers on the chromosomal sequences.

In this course, various models of higher level genome comparison are discussed. We start with the classical breakpoint distance, followed by other simple measures such as SCJ and DCJ. The reversal distance will be discussed, and a general genome rearrangement distance. We will also study methods for the reconstruction of ancestral genomes.

Algorithms discussed in this course are mostly combinatorial by nature, similar to the sequence analysis course.

This course is taught in English.

Teilnahmevoraussetzungen, notwendige Vorkenntnisse

Required: Algorithms and Data Structures (or comparable)
Recommended: Sequence Analysis and Foundations of Genome Research

Externe Kommentarseite

https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2021winter/cg

Lehrende

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Fachzuordnungen

Modul Veranstaltung Leistungen  
39-Inf-SAB_a Spezielle Algorithmen der Bioinformatik Ausgewählte Vorlesung zu Spezielle Algorithmen der Bioinformatik unbenotete Prüfungsleistung
benotete Prüfungsleistung
Studieninformation

Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.


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Kein Lernraum vorhanden
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Letzte Änderung Grunddaten/Lehrende:
Samstag, 9. Oktober 2021 
Letzte Änderung Zeiten:
Mittwoch, 22. Dezember 2021 
Letzte Änderung Räume:
Mittwoch, 22. Dezember 2021 
Art(en) / SWS
V / 2
Sprache
Diese Veranstaltung wird komplett in englischer Sprache gehalten
Einrichtung
Technische Fakultät
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