In dem Praktikum soll eine biologisch motivierte Anwendungsstudie zu RNAs und ihren Funktionen durchgeführt werden. Dabei wird, soweit möglich unter Einsatz aktueller Werkzeuge, nach regulatorischen Motiven in genomischen Sequenzen gesucht. Falls die vorhandenen Methoden nicht ausreichen, sollen die notwendigen Werkzeuge selber (weiter-)entwickelt werden.
Der Besuch der parallel stattfindenden Veranstaltung "RNA structure prediction and comparison" wird dringend empfohlen.
In dem Praktikum werden verschiedene etablierte Bioinformatik Werkzeuge (Blast, RNAfold, Infernal, ...) auf Kommandozeile verwendet. Hierzu sind Kenntnisse von Perl oder einer aequivalenten Scriptsprache notwendig.
Rhythmus | Tag | Uhrzeit | Format / Ort | Zeitraum |
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Modul | Veranstaltung | Leistungen | |
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39-M-Inf-RNA Bioinformatik der RNA | Erkennung regulativer Motive | benotete Prüfungsleistung
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Studieninformation |
Die verbindlichen Modulbeschreibungen enthalten weitere Informationen, auch zu den "Leistungen" und ihren Anforderungen. Sind mehrere "Leistungsformen" möglich, entscheiden die jeweiligen Lehrenden darüber.
Studiengang/-angebot | Gültigkeit | Variante | Untergliederung | Status | Sem. | LP | |
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Bioinformatik und Genomforschung / Master | (Einschreibung bis SoSe 2012) | Vertiefung Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 1. | unbenotet LP s. Vorlesung | ||
Naturwissenschaftliche Informatik / Diplom | (Einschreibung bis SoSe 2004) | allgem.HS; BioI | Teilleistung mündliche Prüfung möglich HS | ||||
Naturwissenschaftliche Informatik / Master | (Einschreibung bis SoSe 2012) | Vertiefung Sequenzanalyse | Wahlpflicht | 1. | unbenotet LP s. Vorlesung |