392133 Computational RNomics (S) (SoSe 2004)

Lange Zeit wurde der RNA nur eine passive Rolle zugeschrieben, als einfacher Informationsträger von der DNA zum Protein. Dabei ist schon seit 20 Jahren bekannt, dass RNA katalytisch wirksam sein kann. So gibt es RNAs die sich selber zerschneiden (hammerhead ribozyme) bzw. splicen (group I/II introns). Auch im Ribosom, der Proteinfabrik, sind es höchstwahrscheinlich RNAs die die Hauptfunktionen ausführen. Mehrere Entdeckungen der letzten Jahre haben darüber hinaus gezeigt, dass kleine RNAs auch regulatorisch wirken können. Diese Entdeckungen wurden von Science als Durchbruch des Jahres 2002 gewürdigt.
Im Seminar sollen, nach einer biologischen Einführung, einige Algorithmen zur Analyse von RNA Sequenzen besprochen werden:

• Repräsentationen von RNA-Strukturen
• Methoden zur Strukturvorhersage (ab-initio, comparativ, Heuristiken)
• Suche von RNA-Genen
• Suche nach RNA-Motiven
• Vergleich von RNA-Strukturen

Teilnahmevoraussetzungen, notwendige Vorkenntnisse

Kenntnisse aus den einführenden Genetikvorlesungen sind hilfreich

Externe Kommentarseite

http://www.techfak.uni-bielefeld.de/ags/pi/lehre/S04.html