205055 Angewandte Python-Programmierung für Biologen (S) (WiSe 2015/2016)

Die Fähigkeit, große Datenmengen zu verarbeiten, zu visualisieren und zu interpretieren ist in vielen Bereichen der Biowissenschaften sehr wichtig und gewinnt weiterhin an Bedeutung. Oft handelt es sich dabei um Abfolgen einfacher Einzelschritte, die hundert oder tausendfach von Hand wiederholt werden müssen und somit sehr zeitraubend sind (z.B. qPCR-Analysen, Sequenzvergleiche, statistische Auswertungen), oder schlicht und einfach um Datensätze, die zu groß sind, um sie mit den handelsüblichen Programmen zu bearbeiten (Next-Generation-Sequencing-Daten, Genomics-Daten).

Dieser Kurs soll dazu dienen, grundlegende Programmierkenntnisse anschaulich zu vermitteln. Dies erfolgt am Beispiel der Skriptsprache Python, weil diese leicht zu erlernen ist und gleichzeitig großes Potential für diverse Anwendungen besitzt. Die Teilnehmer erlernen zunächst die Grundlagen anhand von Übungsaufgaben, die im Seminar bearbeitet und besprochen werden. Durch die Verwendung realer Datensätze sollen die Teilnehmenden dabei in die Lage versetzt werden, nach dem Kurs eigene Problemstellungen zu bearbeiten und sich selbständig weiterzubilden. Die erworbenen Fähigkeiten werden gegen Ende des Semesters für die Bearbeitung eines individuellen Projektes verwendet. Der Beitrag von eigenen Fragestellungen und Daten ist dabei ausdrücklich gewünscht, aber nicht zwingend erforderlich!